自称高麗一の武士で義賊団の頭であるムチ（カン・ハヌル）と海賊船の主のヘラン（ハン・ヒョジュ）。一つの船で運命を共にすることになった彼らだが、風が静まる日がない航海を続けていく。
そんなある日、倭寇船を掃討していた彼らは、消えた王室の宝物がどこかに隠されているという事実を知ることになり、海賊人生で二度とない最大規模の宝物を求め、危険な冒険を始める。
しかし、消えた宝物を捜すのは彼らだけではなかった。
望むものを得るため手段や方法を問わない逆賊プ・フンス（クォン・サンウ）もまた、宝物を求め海に出るのだが…。

韓国映画「海賊：鬼旗（パイレーツ2）」は跡形もなく消えた王室の宝物を求め海に集まった海賊たちのスペクタクルな冒険を描いた作品。
2014年に大ヒットした海洋アドベンチャー「海賊：海に行った山賊」（邦題：パイレーツ）の続編である。