人口10万人当たりの死者数は前年比0．9人減の497．3人で、全般的に男性の死亡率が女性より1．26倍高かった。死亡率を年齢別にみると、30代と10代がそれぞれ前年比6．9%と5．5%増加した半面、80歳以上と1～9歳の死亡率はそれぞれ6．1%、3．1%減少した。
昨年の3大死亡原因はがん（28．3%）、脳血管疾患（10．5%）、心臓疾患（9．0%）で、死者全体の47．8%を占めた。自殺による死者も全体の6．2%を占め、死亡原因の4位となった。交通事故は2．9%を占め、昨年の7位から6位に上昇した。1999年に比べ、順位が上昇した死因は自殺（7位から4位）、糖尿病（6位から5位）など。
死亡原因のトップを年齢別にみると、1～9歳は交通事故、10～30代は自殺、40代以上はがんだった。
昨年のがんによる死亡率は人口10万人当たり140．5人で、肺がん（30．0人）が最も多く、次いで肝臓がん（22．6人）、胃がん（20．4人）と続く。男性は肺がん（43．8人）、肝臓がん（33．9人）、胃がん（26．9%）、女性は肺がん（16．3%）、胃がん（13．9%）、大腸がん（12．7%）の順で多かった。
がん死亡率は前年比0．7%増えた。胃がん死亡率は2．2%減少した半面、男性は前立腺がん（5．3%）、女性は膵臓（すいぞう）がん（11．5%）と乳がん（8．7%）の死亡率は増加した。
男性のがん死亡率は人口10万人当たり176．3人で女性（104．7人）より1．68倍高かった。がん死亡率の男女間の差は、食道がんが11．85倍で最も大きかった。年齢別では20代以下が白血病、30代は胃がん、40～50代は肝臓がん、60代以上は肺がんの死亡率が高かった。
外的要因による死亡率は人口10万人当たり65．8人で、前年比6．6%増加した。前年比で自殺率は19．3%増えた半面、墜落事故（マイナス14．0%）は減少した。外的要因による死亡率は自殺（31．0人）が最も多く、次いで交通事故（14．4人）、墜落事故（4．3人）の順。
新型インフルエンザを含むインフルエンザによる死者は昨年155人で、2003年以降で最も多かった。このうち、新型インフルエンザによる死者は140人で、60代以上の高齢者が52．8%、女性が53．6%を占めた。新型インフルエンザ死亡率は人口10万人当たり0．3人だった。
自殺による死者数は1万5413人で、2008年より2555人（19．9%）増えた。一日平均42．2人、平均34分ごとに1人が自ら命を絶ったことになる。人口10万人当たりの自殺死亡率は31人で、2008年より19．3%増えた。男性は19．7%、女性は18．5%増加した。
自殺率は1990年代から増加を続け、1998年をピークに減少したが、2000年度から再び増え続けており、自殺が深刻な社会問題であることが統計で明確に示されている。
アルコール（酒）関連の死亡者は4430人で、死亡率は前年に比べ5．1%減った。男性が16．1人で女性（1．7人）より9．51倍高く、30代以上で急増し、50代をピークに減少している。
1歳未満の死者数は1415人で、前年より165人（10．4%）減少した。人口1000人当たりの乳児死者数を意味する乳児死亡率は3．2人だった。妊娠・出産と関連した疾患で死亡した妊産婦死者数は48人で、前年に比べ9人増えた。
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